Kariera polityczna

Baboun, mimo braku wcześniejszego doświadczenia w polityce, w 2012 postanowiła kandydować w wyborach samorządowych w Betlejem. Była przewodniczącą Bloku na rzecz Niepodległości i Rozwoju, złożonego z 12 muzułmanów i chrześcijan, którzy należeli do organizacji al-Fatah. Jej ugrupowanie było oceniane przez izraelską prasę jako apolityczne i technokratyczne. W czasie trwania kampanii wyborczej w Betlejem odnotowano najwyższą stopę bezrobocia na terenie całego Zachodniego Brzegu (18%). Ponadto, na skutek emigracji populacji chrześcijańskiej, w tym okresie w mieście doszło do znacznych przeobrażeń demograficznych. Vera Baboun stwierdziła, że źródłem największych problemów Betlejem było wprowadzenie muru bezpieczeństwa – bariery terenowej, zbudowanej z inicjatywy Izraela celem ochrony izraelskich obywateli przed ewentualnymi atakami terrorystycznymi ze strony mieszkańców Zachodniego Brzegu Jordanu. Według Baboun, mur ten był jedynie przeszkodą w rozwoju miasta. Komentatorzy dawali jej małe szanse na wygraną w wyborach. Mimo to jej blok zdobył w wyborach najwięcej głosów. W konsekwencji Baboun została wybrana na urząd burmistrza. Stało się to podczas posiedzenia Rady Miejskiej, na którym uzyskała poparcie 9 radnych (jej przeciwnik otrzymał 6 głosów).

W 2017 roku nie ubiegała się o reelekcję.