Algorytm Needlemana-Wunscha – algorytm oparty na programowaniu dynamicznym, umożliwiający znalezienie optymalnego globalnego dopasowania dwóch sekwencji.

Jest często wykorzystywany w bioinformatyce jako jedno z narzędzi do poszukiwania uliniowienia sekwencji nukleotydowych lub aminokwasowych.

Został stworzony przez Saul B. Needleman’a i Christian D. Wunsch’a oraz opublikowany w roku 1970. Dzieli on większy problem obliczeniowy (np. całą sekwencję) na mniejsze problemy, i używa rozwiązań mniejszych problemów do znalezienia optymalnego rozwiązania dużego problemu.

Przypisy

  1. ↑ SAUL B. NEEDLEMAN, CHRISTIAN D. WUNSCH, A General Method Applicable to the Search for Similarities in the Amino Acid Sequence of Two Proteins, Elsevier, 1989, s. 453–463, DOI: 10.1016/b978-0-12-131200-8.50031-9, ISBN 978-0-12-131200-8 [dostęp 2020-05-27].
  2. ↑ bioinformatics, [w:] Encyclopædia Britannica [dostęp 2022-09-30] (ang.).
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.