Der Ortsname Sankt Margarethen ist nicht eindeutig.

Damit können folgende Orte gemeint sein:

• Sankt Margrethen, eine politische Gemeinde im Kanton St. Gallen in der Schweiz
• Sankt Margarethen (Holstein), eine Gemeinde in Schleswig-Holstein
• Sankt Margarethen im Burgenland, eine Gemeinde im Burgenland
• Sankt Margarethen im Rosental, eine Gemeinde in Kärnten
• Sankt Margarethen an der Siernig, eine Gemeinde in Niederösterreich
• Sankt Margarethen im Lungau, eine Gemeinde in Salzburg
• Sankt Margarethen bei Knittelfeld, eine Gemeinde in der Steiermark
• Sankt Margarethen an der Raab, eine Gemeinde in der Steiermark

Darüber hinaus gibt es noch zahlreiche Ortsteile dieses Namens.